La variante, le stress et la mutation du SRAS-CoV-2 signifient tous des choses différentes – Tech News, Firstpost

Alors que «Mme Rona», connue sous le nom de Coronavirus, célèbre son premier anniversaire depuis son entrée dans nos vies, la demande de termes tels que pandémie, équipement de protection individuelle, anticorps, antigènes, etc. a augmenté et fait désormais partie de notre groupe de vocabulaire quotidien. Beaucoup d’entre nous comprennent peut-être maintenant le processus complexe d’un vaccin en cours de développement, les essais cliniques auxquels il est soumis et les approbations réglementaires dont il peut avoir besoin avant son introduction. Nous avons vécu et appris.

Comme le SRAS-CoV-2 a rapidement «muté», de nouvelles «variantes» du virus sont apparues dans de nombreuses régions du monde. Dans l’ère pré-COVID-19, nous aurions peut-être utilisé cette nouvelle tranche d’informations pour épater les amis ou la famille lors d’un dîner ou d’un cocktail. Mais soyons honnêtes, il est peu probable que les variables en question permettent que cela se produise de sitôt.

Ensuite, plongons et comprenons les bases …

Qu’est-ce qu’un virus?

Avant la pandémie de COVID-19, nous avions mystérieusement entendu parler de virus pathogènes comme Ebola en Guinée et au Congo, de la grippe porcine ou aviaire en Inde et en Russie, du sida, etc., et nous savons maintenant que le SRAS-CoV-2 en est la cause. Maladie COVID-19.

Selon un rapport de Américain scientifiquePendant de nombreuses années, la communauté scientifique a débattu de la définition d’un virus; D’abord comme poison, puis comme forme de vie et ensuite comme biochimique.

Aujourd’hui, les virus se situent quelque part entre un organisme vivant et un organisme inanimé.

une virus Il se compose d’un noyau de matériel génétique (ADN ou ARN) entouré d’une couche protectrice de protéines. Ils peuvent se fixer aux cellules hôtes et utiliser la machinerie de la cellule hôte pour multiplier son matériel génétique. Une fois ce processus de réplication terminé, le virus quitte l’hôte soit en bourgeonnant, soit en dehors de la cellule, le détruisant dans le processus.

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Les virus ne peuvent pas se reproduire seuls, mais une fois qu’ils se lient à la cellule hôte, ils peuvent prospérer et affecter le comportement de la cellule hôte d’une manière qui nuit à l’hôte et profite au virus.

Quelle est la souche?

La souche, selon un rapport de V. Conversation, Est une variante de construction différentielle qui présente des caractéristiques physiques distinctes et se comporte différemment du virus d’origine. Ces différences de comportement peuvent être subtiles ou apparentes.

Les coronavirus, comme le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2), sont parsemés de «mutations» protéiques qui se lient aux récepteurs des cellules de leurs victimes. Le SRAS-CoV-2 est maintenant l’une des rares autres souches connues de la famille des coronavirus, y compris les virus du SRAS et du MERS.

Les experts estiment que le terme race est souvent mal utilisé.

“Il existe une souche du Coronavirus. C’est le SRAS-CoV-2. C’est la seule souche, et il existe différents types de cette souche.” L’indépendant Il a cité le professeur Tom Connor de l’école des sciences biologiques de l’Université de Cardiff.

Qu’est-ce qu’une mutation?

Un virus se compose d’une séquence d’ADN ou d’ARN, qui sont essentiellement une série de lettres nucléotidiques codant pour les gènes de tous les êtres vivants. Tout changement dans ces lettres est appelé une mutation et se produit lorsque la séquence virale se répète. Les mutations se produisent de manière très aléatoire dans le virus – un fait qui pourrait fonctionner pour nous ou contre nous dans un scénario de pandémie. La mutation peut être bénéfique pour le virus et le rendre plus fort, ou elle peut être nocive et réduire sa virulence.

Le SRAS-COV-2, contrairement au virus de la grippe, contient une protéine connue sous le nom d’enzyme de relecture. L’enzyme est similaire à ce que fait un rédacteur en chef de journal, vérifie les fautes d’orthographe sur une page. Cette enzyme effectuera des corrections en fonction de la séquence d’origine du virus. Par conséquent, s’il y a des changements dus à une mutation aléatoire, il essaiera de les corriger.

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Tout comme un éditeur de copie humaine, parfois une mutation glisse à travers l’enzyme de correction et reste. Au fur et à mesure que la particule virale mutante se multiplie, tout son génome, y compris le site de mutation, est répliqué et transmis par les générations futures du virus.

Alors, comment savoir si un virus a muté? C’est là qu’intervient le virologue. Les virologues travaillent sans relâche pour séquencer toutes les variables qui infectent les gens. Le virus d’origine, trouvé à Wuhan, est utilisé pour la comparaison avec les variantes modifiées du coronavirus.

Quelle est l’alternative?

En termes simples, “une variante est une version du virus qui a accumulé suffisamment de mutations pour représenter une branche distincte dans l’arbre généalogique”, Dit Le Dr Amish Adalja, expert en maladies infectieuses, est chercheur principal au Johns Hopkins Center for Health Security.

Chaque mutation et souche d’un virus est une variante, mais chaque variante n’est pas une souche.

La plupart des variantes ne sont pas préoccupantes. En effet, les mutations n’ont provoqué aucun changement radical du virus en question. Cependant, lorsqu’un groupe de mutations se produit, elles peuvent parfois affecter la façon dont le virus se comporte, se propage ou infecte les gens. C’est à ce moment que la variable devient une «variable préoccupante». L’exemple classique est les nouvelles variantes qui se répandent dans certaines régions du Royaume-Uni, de l’Afrique et du Brésil.

Les scientifiques surveillent de près les variantes du SRAS-CoV-2 afin de comprendre comment les modifications génétiques du virus peuvent affecter l’infection (et donc sa propagation), la gravité de la maladie, le traitement et l’efficacité des vaccins disponibles. Dit Dr Thomas Russo, professeur et directeur du département des maladies infectieuses de l’Université de Buffalo, New York.

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Quelles sont les nouvelles variables en circulation?

Un type de SRAS-CoV-2 connu sous le nom de B.1.1.7 se propage à travers le Royaume-Uni depuis décembre 2020, et des cas apparaissent maintenant dans le monde entier. Les scientifiques ont trouvé des preuves que cette variante présente un risque accru de décès par rapport aux autres variantes.

Un graphique parle de la dernière variante du SRAS-CoV-2 qui se propage. Crédit d’image: Centre européen de prévention et de contrôle des maladies

En Afrique du Sud, un autre SRAS-CoV-2 connu sous le nom de B.1.351 est apparu. Il présente certaines similitudes avec la variante britannique et peut également réinfecter les personnes qui se sont rétablies d’autres variantes de COVID-10. Il existe également des preuves que les vaccins AstraZeneca et Moderna ne sont pas efficaces contre cette variante.

Une variante connue sous le nom de P.1 est apparue au Brésil et a été découverte pour la première fois chez l’homme Voyage Du pays sud-américain au Japon. Il existe des preuves que cette variante pourrait affecter la façon dont les anticorps interagissent avec le virus. La mutation dans le variant P.1 empêche les anticorps de reconnaître et de neutraliser le virus.

Selon CDC, Les trois variantes partagent une mutation spécifique appelée D614G qui lui permet de se propager plus rapidement.

Avec de nouvelles variantes qui émergent constamment, il est important d’être au top du jeu de séquençage du génome. En faisant cela, nous pourrons créer de nouvelles variantes d’intérêt de santé publique (car elles peuvent être plus contagieuses, causer des maladies plus graves et développer un vaccin ou une résistance immunitaire) et nous pouvons les faire progresser. Cependant, ignorer ces nouvelles mutations émergentes ne les fera pas disparaître et pourrait nous nuire à long terme.

Avec la contribution de S Krishnaswamy, Professeur émérite de bioinformatique de l’École de biotechnologie, Université de Madurai Camarrage

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